電泳檢驗測定：質粒電泳普通有三條帶，作別為質粒的超螺旋、開環、線型三種構型

吸光值檢驗測定：認為合適而使用分光光度計檢驗測定260nm、280nm波長吸光值，若吸光值260nm/280nm的比率介于1.7－1.9之間，解釋明白質粒品質較好，1.8為*，低于1.8解釋明白有氨基酸污染，大于1.8解釋明白有RNA污染。

實驗材料：包括質粒pUC18載體的結腸桿菌菌液，克隆有稻子外源斷片的BAC的結腸桿菌菌液電熱恒溫鼓風干燥箱。

實驗原理：在pH 12.0 ~ 12.6堿性背景中，球菌的線性大分子量染色體DNA改變性別分開，而共價閉環的質粒DNA固然改變性別但仍處于拓撲攪擾狀況。將pH調至中性并有高鹽存在及低溫的條件下，大多染色體DNA、大分子量的RNA和氨基酸在去污劑SDS的效用下形成沉淀，而質粒DNA還是為可溶狀況。經過離心，可去掉除掉大多細胞碎片、染色體DNA、RNA及氨基酸，質粒DNA尚在上清中，而后用酚、氯仿抽提進一步醇化質粒DNA。

實驗步驟：

1.取包括pUC18質粒的結腸桿菌菌液于LA營養物質上真空干燥箱37℃過夜培育；

2.汲取1.5 ml菌液，12000 g離心2分鐘，使聚在一起菌體，倒掉菌液；汲取1.5 ml菌液，再次使聚在一起菌體，盡力將菌液倒整潔；

3.參加300 ml溶液 I振動打勻，從新懸浮細胞，震動混電熱鼓風干燥箱勻（注意：應*打勻沉淀或碎塊）；

4.用無菌牙簽兒挑取單菌落，接種于包括Amp抗生素的LB營養物質中，37℃搖床~250 r/min過夜培育；

5.參加300 ml溶液III顛倒混勻，安放于冰上10分鐘，使雜質充分沉淀；

6.參加300 ml溶液II，輕柔顛倒混勻，安放至清脆，普通不超過5分鐘；

7.12000 g離心10分鐘；

8.汲取800 ml上清液（注意：不要汲取到漂浮的雜質）至另一Eppendorf管中，參加2/3大小的異丙醇，室溫下安放5分鐘干燥箱；

9.質粒、BAC的品質檢驗測定，于-20℃保留。

10.倒盡上清，加75酒精浸洗除鹽（安放一會兒或離心3分鐘后倒去上清）；

11.12000 g 常溫離心15分鐘；

12.室溫安放或超凈臺上風干DNA；

13.加40 ml滅菌超純水或TE溶解；